MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 15277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015574	AAT	2	6	540118	540123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015574	AT	3	6	540127	540132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015574	TATAA	2	10	540136	540145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_015574	A	9	9	540144	540152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015574	A	7	7	540156	540162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_015574	AGA	2	6	540170	540175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015574	TAA	2	6	540186	540191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015574	TAGG	2	8	540197	540204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015574	AAT	2	6	540517	540522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015574	A	6	6	540534	540539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_015574	TA	3	6	540573	540578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015574	AATTAT	2	12	540599	540610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015574	ACCT	2	8	540626	540633	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_015574	TTAA	2	8	540641	540648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015574	AAT	2	6	540657	540662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_015574	CAATAA	2	12	540694	540705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3017	NC_015574	TTA	2	6	541385	541390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015574	TTATT	2	10	541394	541403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015574	ATT	2	6	541412	541417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015574	ATT	2	6	541423	541428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015574	ATT	2	6	541442	541447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015574	AAG	2	6	541502	541507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015574	A	8	8	541968	541975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015574	GCA	2	6	541985	541990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_015574	GTCCAA	2	12	542017	542028	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015574	A	7	7	542031	542037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_015574	A	8	8	542055	542062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015574	GGAT	2	8	543761	543768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_015574	TCA	2	6	543810	543815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3031	NC_015574	T	6	6	543851	543856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015574	ATT	2	6	543883	543888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015574	T	6	6	543901	543906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015574	ATA	2	6	543974	543979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015574	TAAA	2	8	543995	544002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015574	TTAAT	2	10	544061	544070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_015574	TTAAT	2	10	544078	544087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015574	ATAAG	2	10	544111	544120	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015574	TAA	2	6	544148	544153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015574	T	6	6	546778	546783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015574	ATT	2	6	546803	546808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015574	ATT	2	6	546828	546833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015574	TTTA	2	8	546848	546855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015574	T	7	7	546862	546868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015574	AAC	2	6	546887	546892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_015574	A	7	7	546932	546938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3050	NC_015574	TAT	2	6	548304	548309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015574	TAT	2	6	548334	548339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_015574	GGA	2	6	548693	548698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_015574	ATA	2	6	549829	549834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015574	TTATT	2	10	551305	551314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_015574	T	6	6	551328	551333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_015574	T	8	8	551335	551342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015574	T	7	7	551366	551372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015574	TA	3	6	551394	551399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015574	ACTA	2	8	551478	551485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_015574	ATA	3	9	551515	551523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_015574	A	7	7	552860	552866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015574	TATTT	2	10	552867	552876	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015574	TAAT	2	8	552939	552946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_015574	TAAT	2	8	552956	552963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015574	A	6	6	553051	553056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015574	A	6	6	553059	553064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015574	TTA	2	6	553083	553088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_015574	TAT	2	6	554619	554624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3071	NC_015574	TAT	2	6	554639	554644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_015574	TATTTT	2	12	555114	555125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3074	NC_015574	ATT	2	6	555161	555166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_015574	TGT	2	6	555275	555280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_015574	ACA	2	6	555300	555305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_015574	AAT	2	6	555330	555335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015574	TA	3	6	555345	555350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3083	NC_015574	TTA	2	6	555377	555382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3085	NC_015574	A	6	6	555502	555507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015574	T	6	6	555517	555522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_015574	TA	3	6	557166	557171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_015574	AT	3	6	557717	557722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_015574	A	8	8	559261	559268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015574	A	7	7	559272	559278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015574	TA	3	6	560782	560787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3105	NC_015574	A	8	8	560905	560912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015574	TTAC	2	8	560924	560931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_015574	A	6	6	560971	560976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_015574	AAC	2	6	561530	561535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_015574	CAT	2	6	561536	561541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_015574	TA	3	6	561546	561551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015574	A	6	6	561551	561556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015574	TTA	2	6	561567	561572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015574	GTTT	2	8	561585	561592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015574	T	6	6	561590	561595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015574	TAAA	2	8	561661	561668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015574	AAT	3	9	561680	561688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015574	AAC	2	6	561754	561759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_015574	AG	3	6	561813	561818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015574	ATT	2	6	561848	561853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3121	NC_015574	AGA	2	6	561876	561881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015574	A	6	6	561899	561904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015574	CTT	2	6	561936	561941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_015574	A	8	8	562028	562035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015574	ATT	2	6	562068	562073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015574	TGT	2	6	562085	562090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015574	TAAAAA	2	12	562131	562142	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015574	A	7	7	562146	562152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015574	TA	3	6	562810	562815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015574	CCT	2	6	562817	562822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_015574	T	6	6	562822	562827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015574	A	6	6	562851	562856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_015574	CTG	2	6	562971	562976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_015574	CCG	2	6	563029	563034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_015574	TTTA	2	8	563123	563130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_015574	GT	3	6	563164	563169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_015574	GTT	2	6	563179	563184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_015574	ATTA	2	8	563953	563960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_015574	ATTTT	2	10	565974	565983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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